I file pkg, eseguendo l'update dal sito Apple, installano automaticamente le library nelle cartelle di default. Onestamente non ho cercato se tali pkg vengono salvati da qualche parte sul disco. Dubito. Credo vengano cancellati al termine della fase di installazione.
Quindi, se fosse così, dal time machine potresti recuperare i folder ottenuti dall'installazione ma non i file pkg.
Macbook Pro 14' M1 2020 / SSD 500G SSD Ram 32 Gb Monterey 12.6.3 /Arturia Keylab 49/ Apogee Element 88 /Apogee One / Logic Pro X 10.7.7 / Apple Certified Pro 10.4