Niente da fare. Dopo aver riavviato tutto , stesso problema.
Credo però di aver capito l'inghippo.

Ho provato prima ad assegnare (nell'apposita finestra di preferenze automazioni) un parametro su logic all'unico fader della ozone e funziona. Registra perfettamente. Ma questa è la soluzione rapida nel caso in cui si vuole fare un'assegnazione al volo quando si dispone di pochi controlli esterni.
Ad esempio voglio usare il mod whell di una tastiera per controllre il fader di volume del mixer di logic e dispongo solo di una master keyboard con pith bend e moduation whell? Questa è la soluzione rapida ed efficiente.
Nel mio caso credo che il problema fosse questo. Logic registra le automazioni solo e soltanto da quei controlli che sono stati "mappati" nella finestra "controller assignement".
Se non sono lì, il controller funziona lo stesso per i comandi "standard" tipo pitch bend, mod whell, ma non ne registra le automazioni.
Ora funziona tutto bene e le impostazioni di mappatura restano definitive ad ogni riavvio.
Spero di aver capito bene e di aver fatto la cosa giusta...