Ciao, ora mi è chiara la domanda.

Le modalità di apertura dei plugins dipendono dal segnale che gli arriva in input, per cui il primo plugin che apri sul canale si potrà aprire in funzione di quale input fisico hai impostato.
Se hai impostato un input mono le scelte sono: Mono e Mono>Stereo
Se hai impostato un input Stereo le scelte sono: Stereo e Dual Mono

Le cose cambiano dal secondo plugin in poi perchè come dicevo le scelte variano in base al segnale che si trova in input.
Scenario:
Input fisico mono e primo plugin impostato in modalità Mono>Stereo.
in questo caso l'uscita del primo plugin è stereo, di conseguenza al plugin successivo arriva un segnale stereo....ed ecco che le scelte posso essere diverse tra le quali appunto Stereo, Mono>Stereo, Dual Mono

Quale è la scelta migliore? Non c'è una scelta migliore o peggiore, dipende cosa vuoi ottenere. Sicuramente nel tuo caso non userai mai Dual Mono.